应用PCR-DGGE技术检测发酵食品和饲料中真菌菌群

doi:10.7506/spkx1002-6300-201007070

食品科学 ›› 2010, Vol. 31 ›› Issue (7): 317-322.doi: 10.7506/spkx1002-6300-201007070

应用PCR-DGGE技术检测发酵食品和饲料中真菌菌群

许爱清^{1 , 2}，李宗军^{1 ,*} ，王远亮¹，文杰宇¹

1.湖南农业大学食品科学与技术学院 2.湖南科技大学生命科学学院

收稿日期:2009-07-30 出版日期:2010-04-01 发布日期:2010-12-29
通讯作者: 李宗军 E-mail:lizongjun@yahoo.com.cn
基金资助:
湖南省重大科技专项(2008FJ1005)

A Review of PCR-DGGE Detection of Fungal Community in Fermented Food and Feedstuff

XU Ai-qing1,2，LI Zong-jun1,*，WANG Yuan-liang1，WEN Jie-yu1

1. Institute of Food Science and Technology, Hunan Agricultural University, Changsha 410128, China；
2. School of Life Science, Hunan University of Science and Technology, Xiangtan 411201, China

Received:2009-07-30 Online:2010-04-01 Published:2010-12-29
Contact: LI Zong-jun E-mail:lizongjun@yahoo.com.cn

摘要/Abstract

摘要：

PCR-DGGE 技术是近年来新兴的一项开展微生物分子生态学研究的工具。本文介绍了PCR-DGGE 技术的基本原理和技术背景，总结了应用PCR-DGGE 研究发酵食品和饲料中真菌菌群时所设计或选择的PCR 引物，图示了获得DGGE 图谱中DNA 条带序列信息的实验流程，并列举了DGGE 技术的一些局限性和优化策略。综述结果有助于建立可行的PCR-DGGE 技术方案用于发酵过程或产品中真菌群落结构和演替规律的检测分析。

关键词: 变性梯度凝胶电泳, 发酵食品, 真菌菌群, PCR 引物

Abstract:

PCR-DGGE technique is a recently emerging tool in microbial ecology. In this paper, the principle and background of PCR-DGGE are introduced. Meanwhile, the design and choice of PCR primers are summarized in investigation of fungal community in fermented food and feedstuff. Moreover, the experimental procedure to obtain DNA sequence information from DGGE profiles is demonstrated. Furthermore, limitations and optimization strategies of DGGE are also listed. This paper will be helpful for establishing a feasible PCR-DGGE protocol to detect fungal community structure and deduce succession pattern during fermentation process or in fermented products.

Key words: denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE), fermented foodstuff, fungal community, PCR primers

中图分类号:

Q938

许爱清1,2，李宗军1,*,王远亮1，文杰宇1. 应用PCR-DGGE技术检测发酵食品和饲料中真菌菌群[J]. 食品科学, 2010, 31(7): 317-322.

XU Ai-qing1,2，LI Zong-jun1,*，WANG Yuan-liang1，WEN Jie-yu1. A Review of PCR-DGGE Detection of Fungal Community in Fermented Food and Feedstuff[J]. FOOD SCIENCE, 2010, 31(7): 317-322.

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