基于16S rRNA基因DNA条形码鉴定美洲鳗、欧洲鳗、日本鳗

doi:10.7506/spkx1002-6630-201704046

食品科学 ›› 2017, Vol. 38 ›› Issue (4): 283-289.doi: 10.7506/spkx1002-6630-201704046

基于16S rRNA基因DNA条形码鉴定美洲鳗、欧洲鳗、日本鳗

陈文炳，缪婷玉，彭娟，邵碧英，陈彬，江树勋，张志灯

福建出入检验检疫局检验检疫技术中心，福建福州 350003

出版日期:2017-02-25 发布日期:2017-02-28
基金资助:
福建省科技计划农业引导性项目（2015N0016）

Identification of Anguilla rostrata, Anguilla anguilla and Anguilla japonica Using DNA Barcoding Based on 16S rRNA Gene

CHEN Wenbing, MIAO Tingyu, PENG Juan, SHAO Biying, CHEN Bin, JIANG Shuxun, ZHANG Zhideng

Inspection and Quarantine Technology Center, Fujian Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau, Fuzhou 350001, China

Online:2017-02-25 Published:2017-02-28

摘要/Abstract

摘要： 为满足鳗鱼养殖、加工、贸易企业及执法部门的需求，建立我国主要养殖鳗鱼美洲鳗（Anguillarostrata）、欧洲鳗（Anguilla anguilla）、日本鳗（Anguilla japonica）的物种DNA条形码鉴定方法。以扩增16SrRNA基因的通用引物扩增美洲鳗、欧洲鳗、日本鳗的16S rRNA基因片段，各获得1 条16S rDNA片段，测序结果表明，前二者的长度均为638 bp、日本鳗的长度为640 bp，为了使物种鉴定方法更简便，结果更准确，从各自片段中截取具有物种特异序列的片段（243 bp），作为3 种鳗鱼的标准DNA条形码，设计两端碱基数分别为22 bp与23 bp的正向与反向引物，建立聚合酶链式反应-DNA条形码检测方法。3年来的应用结果表明：建立的美洲鳗、欧洲鳗、日本鳗3 种鳗鱼的DNA条形码鉴定方法，操作简便、准确、稳定，可应用于3 种鳗鱼的物种鉴定。

关键词: 美洲鳗, 欧洲鳗, 日本鳗, 16S rRNA基因, DNA条形码, 鉴定

Abstract: To meet the demands of enterprises engaged in eel farming, processing and trading and law enforcements, a DNA barcoding method for the identification of three main farmed eel species, Anguilla rostrata, A. Anguilla and A. japonica, was developed. Universal 16S rRNA primers were designed and used to amplify partial 16S rRNA gene fragments of A. rostrata, A. Anguilla and A. japonica and their PCR products were sequenced to be 638, 638 and 640 bp in length, respectively. The specific DNA fragment (243 bp) was selected as standard DNA barcode with eel species specificity to identify eel species conveniently, and a forward primer (22 bp) and a reversed primer (23 bp) were designed and used to establish the PCRDNA barcoding method. The results of the application of the proposed method over the past three years showed that it is convenient, accurate, stable, and useful to identify the three eel species.

Key words: A. rostrata, A. Anguilla, A. japonica, 16S rRNA gene, DNA barcode, identification

中图分类号:

S917.4
Q78

陈文炳，缪婷玉，彭娟，邵碧英，陈彬，江树勋，张志灯. 基于16S rRNA基因DNA条形码鉴定美洲鳗、欧洲鳗、日本鳗[J]. 食品科学, 2017, 38(4): 283-289.

CHEN Wenbing, MIAO Tingyu, PENG Juan, SHAO Biying, CHEN Bin, JIANG Shuxun, ZHANG Zhideng. Identification of Anguilla rostrata, Anguilla anguilla and Anguilla japonica Using DNA Barcoding Based on 16S rRNA Gene[J]. FOOD SCIENCE, 2017, 38(4): 283-289.

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基于16S rRNA基因DNA条形码鉴定美洲鳗、欧洲鳗、日本鳗

Identification of Anguilla rostrata, Anguilla anguilla and Anguilla japonica Using DNA Barcoding Based on 16S rRNA Gene

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