中国对虾过敏原基因特征的生物信息学分析

doi:10.7506/spkx1002-6630-200905040

食品科学 ›› 2009, Vol. 30 ›› Issue (5): 175-178.doi: 10.7506/spkx1002-6630-200905040

中国对虾过敏原基因特征的生物信息学分析

李振兴¹，林洪^{1 ,*} ，王晓斐¹，郭永超¹，张轶群¹，李小燕¹，吕朋²

1.中国海洋大学水产品安全性实验室 2.山东省出入境检验检疫局

收稿日期:2008-03-18 修回日期:2008-08-07 出版日期:2009-03-01 发布日期:2010-12-29
通讯作者: 林洪 E-mail:linhong@ouc.edu.cn
基金资助:
国家“863”计划项目 (2006AA09Z427)

Bioinformatics Analysis of Allergen Gene Characteristics of Penneropenaeus chinensis

LI Zheng-xing1，LIN Hong1,*，WANG Xiao-fei1，GUO Yong-chao1，ZHANG Yi-qun1，LI Xiao-yan1，LU Peng2

(1.Seafood Safety Laboratory, Ocean University of China, Qingdao 266003, China；
2.Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau of Shandong Province, Qingdao 266001, China)

Received:2008-03-18 Revised:2008-08-07 Online:2009-03-01 Published:2010-12-29
Contact: LIN Hong1,*， E-mail:linhong@ouc.edu.cn

摘要/Abstract

摘要：

为了研究过敏原基因的基本性质、探讨过敏的机理，对中国对虾过敏原基因的部分序列进行克隆、测序，并分析该基因的有效密码子，碱基组成、密码子的偏好性，以及过敏原蛋白的氨基酸组成等性质。结果表明：中国对虾过敏原的部分基因序列长为1034，共编码264 个氨基酸，密码子的偏好性强，不同海产动物过敏原基因的有效密码子及碱基含量有很大的相似性。从基因序列和氨基酸序列的角度看，中国对虾的过敏原蛋白与其他种类海产甲壳动物的过敏原蛋白具有很强的相似性，这可能是导致海产品过敏原蛋白活性交叉反应的重要原因之一。

关键词: 虾, 过敏原基因, 过敏原蛋白, 生物信息学

Abstract:

To study gene characteristics of shrimp allergen and discuss the mechanism of food allergy, part of Chinese shrimp (Penneropenaeus chinensis) allergen gene was cloned, and its sequence, effective codes, base composition, codon preference as well as amino acid composition of allergen protein were determined. The results showed that the length of shrimp allergen gene is 1034 bp, the allergen protein is composed by 641 amino acids and the codon preference is high. According to the homology comparison between gene and amino acid sequences, the allergen protein of Chinese shrimp is highly similar to that of other sea crustaceans. This might be one of the important reasons to lead to the occur of activity cross reaction among allergen proteins in various seafoods.

Key words: shrimp, allergen gene, allergen protein, bioinformatics

中图分类号:

TS254.1
Q786

李振兴1，林洪1,*,王晓斐1，郭永超1，张轶群1，李小燕1，吕朋2. 中国对虾过敏原基因特征的生物信息学分析[J]. 食品科学, 2009, 30(5): 175-178.

LI Zheng-xing1，LIN Hong1,*，WANG Xiao-fei1，GUO Yong-chao1，ZHANG Yi-qun1，LI Xiao-yan1，LU Peng2. Bioinformatics Analysis of Allergen Gene Characteristics of Penneropenaeus chinensis[J]. FOOD SCIENCE, 2009, 30(5): 175-178.

[1]	王富云，王成财，王哲铭，江虹锐，闵斗勇，刘小玲，李树波. 虾青素微球对酸奶品质与风味的影响[J]. 食品科学, 2021, 42(8): 172-178.
[2]	周雅琪，黄佳茵，陈美玉，葛雨珺，李苑，胡亚芹. 亚牛磺酸对南美白对虾多酚氧化酶活性及酶构象的影响[J]. 食品科学, 2021, 42(4): 100-106.
[3]	徐姝，刘冬梅，王勇，陈东坡，周鹏. 蒸烤模式对南美白对虾食用品质的影响[J]. 食品科学, 2021, 42(3): 136-142.
[4]	祁雪儿，毛俊龙，姚慧，齐贺，武天昕，水珊珊，张宾. 蛋白质氧化对中华管鞭虾肌肉品质特性的影响[J]. 食品科学, 2021, 42(18): 15-21.
[5]	王俊娟，李欣芮，陈成，孙善峰，刘桂蓉，车会莲. 花生主要过敏原Ara h 1线性B细胞表位的预测及鉴定[J]. 食品科学, 2021, 42(17): 106-112.
[6]	郭新明，吴丽君，赵静，田俊生. 虾青素补充对人体急性高强度运动前后代谢的影响[J]. 食品科学, 2021, 42(17): 177-185.
[7]	潘海博，覃璐琪，黄燕婷，梁晓琳，黄国宏，聂梦琳，饶川艳，梅丽华，李全阳. 人工神经网络结合遗传算法优化保护剂提高罗伊氏乳杆菌抗冻性能[J]. 食品科学, 2021, 42(14): 70-77.
[8]	张晨曦，张晓荣，吕晨艳，赵广华. 超声辅助法制备铁蛋白-虾青素包埋物[J]. 食品科学, 2021, 42(11): 94-101.
[9]	陈启航，文丽华，陈小娥，方旭波，凌建刚，宣晓婷. 超高压辅助脱壳对虾夷扇贝肌原纤维蛋白生化特性及结构的影响[J]. 食品科学, 2021, 42(11): 102-107.
[10]	陈菁，杜振兴，陈建平，贾学静，刘晓菲，李瑞，钟赛意. 虾头类肝素的制备、理化性质及抗凝血活性评价[J]. 食品科学, 2021, 42(11): 71-77.
[11]	李文亚，刘洋，李宁，郑晓卫，桑亚新，孙纪录. 蛋白酶制剂对虾酱发酵过程中理化性质和微生物区系的影响[J]. 食品科学, 2021, 42(10): 184-192.
[12]	赵艳芳，康绪明，宁劲松，翟毓秀，尚德荣，丁海燕，盛晓风. 虾蛄可食组织中镉和砷的形态及分布特征[J]. 食品科学, 2020, 41(8): 282-287.
[13]	员冬玲，耿文广，杜锐，孙荣峰，王寿权，赵改菊. 南美白对虾过热蒸汽干燥特性及干燥数学模型[J]. 食品科学, 2020, 41(3): 62-67.
[14]	甘晖，米强，韦恺丽，杨明伟，卢小花，陈世富，吕敏，马华威. 壳聚糖-茶多酚复合物对冷藏南美白对虾的微生物区系与品质的影响[J]. 食品科学, 2020, 41(23): 212-220.
[15]	姜明慧，田元勇，闫丽新，王选飞，袁春红，刘俊荣. 冷藏过程中虾夷扇贝横纹肌微观结构变化与肌原纤维蛋白稳定性[J]. 食品科学, 2020, 41(21): 175-181.

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