RAPD-PCR快速鉴定啤酒污染菌的研究

食品科学 ›› 2007, Vol. 28 ›› Issue (11): 331-337.

RAPD-PCR快速鉴定啤酒污染菌的研究

郑飞云, 朱林江, 李永仙, 李崎, 顾国贤

江南大学教育部工业生物技术重点实验室；江南大学教育部工业生物技术重点实验室江苏无锡214122；江苏无锡214122；

出版日期:2007-11-15 发布日期:2011-11-22

Study on Application of RAPD Fingerprint on Rapid Identification for Beer Spoilage

ZHENG Fei-Yun, ZHU Lin-Jiang, LI Yong-Xian, LI Qi, GU Guo-Xian

Key Laboratory of Industrial Biotechnology, Ministry of Education, Jiangnan University, Wuxi 214122, China

Online:2007-11-15 Published:2011-11-22

摘要/Abstract

摘要： 本研究主要评价RAPD-PCR技术在快速鉴定啤酒污染菌中的应用。首先评价了CTAB法和试剂盒提取DNA模板对RAPD指纹稳定性的影响以及乳酸菌专一性BP引物扩增的16SrDNA的5’末端740bp序列用于鉴定菌种的可行性,采用PCR产物直接测序鉴定分离的污染菌,构建标准污染菌库。对分离菌M-13的RAPD指纹聚类分析表明,相同来源的同一种菌能很好地归类在一起。根据建立的快速鉴定流程和初步确定的菌种相似性阈值(SCC),对8株分离菌的鉴定表明,RAPD-PCR技术是一项简单、快捷、可靠性强的鉴定技术,为研究啤酒酿造过程的污染菌提供了一个非常有用的快速鉴定工具。

关键词: 啤酒污染菌, RAPD, CTAB, 相似性阈值, M-13

Abstract: The application of RAPD (random amplified polymorphic DNA) as a method for rapid identification for beer spoilage was evaluated in the paper. The effects of CTAB (cetyltrimethylammonium bromide) DNA extraction method and commercial kit on the fingerprint reproducibility were compared and it showned that the variability of RAPD fingerprint was small. The possibility to identify isolates with the 740bp sequence from 5’ end of 16SrDNA was evaluated, which could be amplified with primer BP. The isolates were identified by PCR (polymerase chain reaction) product direct sequencing method. A small library was implemented by cluster analysis of RAPD fingerprint of those strains with primer M-13, which was proved to be useful for the isolates classification. Rapid identification of eight isolates was carried out according to the identification procedure and cut- off species similarity coefficient. It suggested that the RAPD-PCR technique is simple, fast and reliable for identification, proved to be an useful tool for studying the beer spoilage in the process of brewing.

Key words: beer spoilage, RAPD, CTAB, similarity coefficient cut-off, M-13

郑飞云, 朱林江, 李永仙, 李崎, 顾国贤. RAPD-PCR快速鉴定啤酒污染菌的研究[J]. 食品科学, 2007, 28(11): 331-337.

ZHENG Fei-Yun, ZHU Lin-Jiang, LI Yong-Xian, LI Qi, GU Guo-Xian. Study on Application of RAPD Fingerprint on Rapid Identification for Beer Spoilage[J]. FOOD SCIENCE, 2007, 28(11): 331-337.

[1]	张秋雪，刘晓婵，朱宗涛，万峰，孙思睿，贾芳芳，孟祥晨. 婴儿粪便长双歧杆菌的分离与多样性分析[J]. 食品科学, 2017, 38(24): 8-14.
[2]	李凯1，朱成龙1，吕珍1，杨芮1，但霞1，刘树文1,2,*. 植物乳杆菌抗酸相关基因的序列特征性扩增区域(SCAR)标记[J]. 食品科学, 2013, 34(19): 181-185.
[3]	冯敏，刘延琳. RAPD 在酵母分类鉴定与育种研究中的应用[J]. 食品科学, 2012, 33(9): 267-270.
[4]	周?宁，张建新，樊明涛，王?静，李子龙，魏新元*. 酸奶中保加利亚乳杆菌药物敏感性分析[J]. 食品科学, 2012, 33(21): 202-207.
[5]	翟平平1，李嘉文1，王芳2，熊燕2，李睿1,*. 肠出血性大肠杆菌变种的RAPD分型研究[J]. 食品科学, 2012, 33(17): 184-187.
[6]	高树刚，宋伟明，安红. 混合反胶团提取α-淀粉酶[J]. 食品科学, 2011, 32(21): 214-217.
[7]	马成杰1，吴正钧1，杜昭平2，刘鑫2，马爱民2,*. 不同品牌酸乳中德氏乳杆菌的分离鉴定及RAPD分析[J]. 食品科学, 2010, 31(7): 177-181.
[8]	刘树文1,2，李西柱2，王坐京2，周立国2. 酒酒球菌抗酸相关基因RAPD标记的筛选[J]. 食品科学, 2010, 31(7): 190-195.
[9]	刘伟，李兴民*,郑海涛，刘毅. 十六烷基三甲基溴化铵和乳清蛋白结合的研究[J]. 食品科学, 2010, 31(21): 24-28.
[10]	宿红艳，王磊*,王仲礼，王丹. 十个白灵菇栽培菌株的遗传多样性分析[J]. 食品科学, 2009, 30(5): 158-161.
[11]	陈彦1,2，潘见1,*，王亚2，惠爱玲1，杨毅1. 大豆DNA提取方法及降落PCR检测转基因成分的研究[J]. 食品科学, 2009, 30(24): 355-358.
[12]	王磊，宿红艳*,滕长英，韩立亚，辛成齐. 中国猴头菇栽培菌株的系统进化研究[J]. 食品科学, 2009, 30(23): 270-273.
[13]	李党生，王振伟. 高压诱变啤酒酵母研究及其突变株RAPD 分析[J]. 食品科学, 2009, 30(21 ): 225-228.
[14]	林媛1，陈文炳2,*，邵碧英2，王泽生3，廖剑华3，李寿崧2，江树勋2. 双孢蘑菇RAPD标记的遗传多样性分析[J]. 食品科学, 2009, 30(20 ): 272-276.
[15]	刘鑫1，马成杰1,2，杨双熙1，杜昭平1，马爱民1,*. 市售酸乳中嗜热链球菌的分离及RAPD分析[J]. 食品科学, 2009, 30(11): 185-188.