“班菲”脐橙果皮油斑病相关基因的分析

doi:10.7506/spkx1002-6630-201317047

食品科学

“班菲”脐橙果皮油斑病相关基因的分析

魏召新1，程春振2，程昌凤1，吴纯清1，朱世平2，漆巨容1，洪林1,*

1.重庆市农业科学院果树研究所，重庆 402260；2.西南大学柑桔研究所，重庆 400712

出版日期:2013-09-15 发布日期:2013-09-27
通讯作者: 洪林
基金资助:
重庆市科技攻关计划项目(CSTC2009AB1107)

Genetic Analysis of Oleocellosis in Navel Orange ‘Banfield’

WEI Zhao-xin1，CHENG Chun-zhen2，CHENG Chang-feng1，WU Chun-qing1，ZHU Shi-ping2，QI Ju-rong1，HONG Lin1,*

1. Fruit Research Institute, Chongqing Academy of Agricultural Sciences, Chongqing 402260, China；
2. Citrus Research Institute, Southwest University, Chongqing 400712, China

Online:2013-09-15 Published:2013-09-27
Contact: HONG Lin

摘要/Abstract

摘要：

柑橘油斑病作为一种普遍发生的柑橘病害，严重影响着果实的外观和商品价值。以晚熟脐橙“班菲”为材料，利用抑制差减杂交技术分别构建油斑病诱导的正反向cDNA文库。文库插入片段多在100～700bp之间，从正反向文库中各随机挑取了150个菌液PCR检测为阳性的克隆进行测序，成功获得了有效ESTs序列292条。通过BLASTx序列比对，有165条ESTs找到了55个基因的同源序列，且E值小于1.0×10-3。GO功能归类结果表明：这些差异表达的ESTs主要涉及氧化还原、抗逆防御、生物和非生物胁迫等多种相关的生物学过程，推测油斑病的形成与氧化胁迫有关。

关键词: 柑橘油斑病, 抑制性差减文库, 差异表达基因, 氧化胁迫, 实时定量PCR

Abstract:

Oleocellosis, a widely distributed citrus disease, has a significant impact on the appearance and
commercial value of citrus fruits. To clarify the molecular mechanism of citrus oleocellosis, both forward and
reverse cDNA suppression subtractive hybridization libraries were constructed using RNA extracted from navel
oranges ‘Banfield’ with oleocellosis and healthy ones. Results showed that the length of majority of the inserts
ranged from 100 to 700 bp. A total of 292 clones were successfully sequenced from 300 randomly picked
positive clones, among which 165 ESTs in 55 genes were identified to share high homology with known genes
with E-value ＜ 1.0×10-3. GO and KEGG analysis showed that these differentially expressed genes (DEGs)
were mainly involved in redox stress, defense response, and biotic or abiotic stress. We therefore speculated that oxidative
stress might contribute to the formation of oleocellosis.

Key words: citrus oleocellosis, suppression subtractive hybridization (SSH), differentially expressed genes (DEGs), oxidative stress, real-time PCR

中图分类号:

魏召新1，程春振2，程昌凤1，吴纯清1，朱世平2，漆巨容1，洪林1,*. “班菲”脐橙果皮油斑病相关基因的分析[J]. 食品科学, doi: 10.7506/spkx1002-6630-201317047.

WEI Zhao-xin1，CHENG Chun-zhen2，CHENG Chang-feng1，WU Chun-qing1，ZHU Shi-ping2，QI Ju-rong1，HONG Lin1,*. Genetic Analysis of Oleocellosis in Navel Orange ‘Banfield’[J]. FOOD SCIENCE, doi: 10.7506/spkx1002-6630-201317047.

[1]	娄海伟，赵玉，赵逸，林俊芳，赵仁勇，叶志伟，郭丽琼. 蛹虫草转录组分析及类胡萝卜素生物合成相关基因的挖掘[J]. 食品科学, 2021, 42(6): 150-156.
[2]	王婷，刘婵婵，任娟，荆蓉蓉，钱卫东. 亚硒酸钠促进多形汉逊酵母DL-1合成谷胱甘肽的转录组学分析[J]. 食品科学, 2021, 42(6): 193-199.
[3]	宋媛，胡秋辉，苏安祥，裴斐，马高兴，马宁，杨文建. 转录组学解析茉莉酸甲酯对双孢蘑菇个体大小的影响机制[J]. 食品科学, 2021, 42(4): 130-137.
[4]	张高川，何超永，王崇龙，王大慧，卫功元. 转录组测序分析氯化钠对普鲁兰生物合成的影响[J]. 食品科学, 2021, 42(18): 45-50.
[5]	彭博，李炳娟，关文强，林琼. 双孢蘑菇转录组测序及褐变相关基因的挖掘[J]. 食品科学, 2019, 40(2): 126-132.
[6]	王立梅，任清华，郑丽雪，孙姜，齐斌，朱益波. 内源性氧化胁迫促进酿酒酵母合成谷胱甘肽的潜在机制分析[J]. 食品科学, 2017, 38(4): 26-31.
[7]	周密，唐毓祎，王旭，张炜佳，潘迎捷，赵勇. NaClO胁迫下单核细胞增生李斯特菌WaX12 及其sigB基因缺失突变株抗氧化胁迫相关功能基因表达比较[J]. 食品科学, 2017, 38(10): 49-54.
[8]	李超兰，杨其亚，张红印*，张晓云. 活性氧影响拮抗菌及果蔬采后抗病性的研究进展[J]. 食品科学, 2014, 35(21): 264-269.
[9]	王晓娜1，徐晓敏1，邱理红1，李刚2，许波2，马成俊2，王振华1,2,*. 羟基红花黄色素A对过氧化氢致L02细胞谷胱甘肽氧化的影响[J]. 食品科学, 2013, 34(23): 317-320.
[10]	吕胜男，赵瑞瑞，申琳，赵丹莹，生吉萍,. 系统Ⅱ乙烯对采后番茄果实抗冷过程中抗氧化酶的影响[J]. 食品科学, 2012, 33(8): 296-300.
[11]	聂志强，王?敏*，郑?宇. 三种分子生物学技术在传统发酵食品微生物多样性研究中的应用[J]. 食品科学, 2012, 33(23): 346-350.
[12]	王小花1，李建祥1，王国卿2，李新莉1，邵景东3，傅春玲1,*. SYBR Green实时荧光定量PCR检测大豆转基因成分[J]. 食品科学, 2009, 30(8): 171-176.
[13]	胡娜1，许杨2,*. 基因芯片在黄曲霉毒素生物合成相关基因差异表达分析中的应用研究[J]. 食品科学, 2009, 30(17): 208-211.
[14]	赵丹莹，申琳，于萌萌，郑杨，生吉萍*. 采后番茄果实抗氧化酶活与抗冷性的关系[J]. 食品科学, 2009, 30(14 ): 309-313.
[15]	朱燕, 徐幸莲, 罗欣, 周光宏. 钙离子对钙激活蛋白酶mRNA表达、活性及其对肌肉蛋白降解的影响[J]. 食品科学, 2007, 28(5): 25-28.

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