高通量二代测序基因条码技术在油料作物种类鉴别中的应用

doi:10.7506/spkx1002-6630-201424067

食品科学

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高通量二代测序基因条码技术在油料作物种类鉴别中的应用

吴亚君，杨艳歌，李莉，王斌，刘鸣畅，陈颖*

中国检验检疫科学研究院，北京 100123

出版日期:2014-12-25 发布日期:2014-12-29
通讯作者: 陈颖
基金资助:
国家高技术研究发展计划（863计划）项目（2011AA100807）；公益性（质检）行业科研专项（201110015）

Application of High Throughput Next-Generation Sequencing Based on DNA Barcoding Technology in Species Identification of Edible Oils

WU Ya-jun, YANG Yan-ge, LI Li, WANG Bin, LIU Ming-chang, CHEN Ying*

Chinese Academy of Inspection and Quarantine, Beijing 100123, China

Online:2014-12-25 Published:2014-12-29
Contact: CHEN Ying

摘要/Abstract

摘要：

对高通量二代测序基因条码技术在油料作物种类鉴别中的应用进行探索。采用Ion Torrent PGMTM测序技术，分别对橄榄、花生、大豆、油葵、玉米等14 种油料作物和小麦、大米的叶绿体核酮糖二磷酸羧化酶/氧化酶大亚基（ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit，rbcL）基因246 bp聚合酶链式反应（polymerasechain reaction，PCR）产物混合物，及上述作物DNA混合液扩增得到的rbcL基因片段进行测序。结果表明，除小麦外，所有其他作物成分均获得了鉴定。其中，PCR产物混合物中每种作物成分的测序读数数量比例和该成分PCR产物在总产物中的比例接近，说明该技术可以用于定量分析。实验结果初步证实了该技术对混合样品中各作物种类鉴别的准确性，并具有检测效率、流程简便的特点，有望在未来成为食用油标识符合性查验的有力工具。

关键词: 二代测序, 基因条码, 油料, 检测

Abstract:

This study aimed to testify the application of second-generation sequencing based on DNA barcoding technology
in the species identification of edible oils. Totally 14 species of oil crops including olive, peanut, soybean, oil sunflower,
maize, sesame, camellia, rapeseed, palm and pine nut as well as rice and wheat were selected. Mixtures of the polymerase
chain reaction (PCR) products of the 240 bp ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (rbcL) genes and
the rbcL genes amplified from DNA mixtures of these 16 crop species were sequenced by Ion Torrent PGMTM respectively.
The results demonstrated that all crop species except wheat were successfully identified. As for two mixture samples, the
reading ratio of each plant was consistent with the proportion of its PCR product. This study preliminarily proved that the
combined technique is capable of identifying the plant species in blended oils accurately and efficiently. The procedure could
be streamlined to be a promising detection method for oil product supervision in the near future.

Key words: next-generation sequencing, DNA barcoding, edible oil crops, detection

中图分类号:

TS227

吴亚君，杨艳歌，李莉，王斌，刘鸣畅，陈颖*. 高通量二代测序基因条码技术在油料作物种类鉴别中的应用[J]. 食品科学, doi: 10.7506/spkx1002-6630-201424067.

WU Ya-jun, YANG Yan-ge, LI Li, WANG Bin, LIU Ming-chang, CHEN Ying*. Application of High Throughput Next-Generation Sequencing Based on DNA Barcoding Technology in Species Identification of Edible Oils[J]. FOOD SCIENCE, doi: 10.7506/spkx1002-6630-201424067.

[1]	田林双，顾鹏程，吴存兵，徐澳，豆雪梅，史凤珍，陈飞. 小麦粉及其制品中偶氮甲酰胺检测方法研究进展[J]. 食品科学, 2021, 42(9): 347-354.
[2]	李伊宁，黄昆仑，姚志轶. 用于叶酸检测的荧光传感器构建及应用研究进展[J]. 食品科学, 2021, 42(9): 214-221.
[3]	宁亚维，刘茁，杨正，马俊美，范素芳，李强，张岩. UPLC-MS/MS法同时检测食品中3种主要牛奶过敏原[J]. 食品科学, 2021, 42(8): 270-276.
[4]	王玥，邵琳，李乾学，易乐，曲晗，王洪利，沈明浩. 适配体结合量子点技术同时检测金黄色葡萄球菌和大肠埃希氏菌O157:H7方法[J]. 食品科学, 2021, 42(8): 305-312.
[5]	田景升，李东东，赵玲钰，高文惠. 喹乙醇印迹传感器的制备及其在喹噁啉类药物残留快检中的应用[J]. 食品科学, 2021, 42(6): 316-324.
[6]	刘娜，曹强，肖雨诗，黄蓉，程雷，刘欢，韩刚，李晋成，李梦龙，吴立冬. 基于多巴胺及其衍生物的传感器在食品快速检测中的研究进展[J]. 食品科学, 2021, 42(5): 332-339.
[7]	陈巧莉，杨兵，洪晴悦，魏鲟钰，方楚楚，阚建全. 海洋生物毒素的分类、毒害作用机制及检测技术研究进展[J]. 食品科学, 2021, 42(5): 321-331.
[8]	赵非，陈宝英，李克峰，王旭. 高效液相色谱-荧光检测法测定红肉及其加工肉中唾液酸含量[J]. 食品科学, 2021, 42(4): 313-318.
[9]	黄佳茵，周雅琪，陈美玉，李苑，吴甜甜，胡亚芹. 基于甲基纤维素改性聚乙烯醇指示膜的制备、表征及对南美白对虾的鲜度指示[J]. 食品科学, 2021, 42(3): 194-203.
[10]	吴有雪，吴美娇，田亚晨，王政，郭亮，刘程，方水琴，刘箐. 沙门氏菌检测生物传感器研究进展[J]. 食品科学, 2021, 42(3): 339-345.
[11]	付瑞杰，周静，田风玉，焦必宁，何悦. 基于纳米材料的光学适配体传感器在农药残留检测中的应用研究进展[J]. 食品科学, 2021, 42(3): 330-338.
[12]	山珊，黄昭鸿，黄艳梅，刘道峰，刘成伟，黄运红，龙中儿. 不对称PCR技术结合免疫层析法快速检测产志贺毒素大肠埃希氏菌[J]. 食品科学, 2021, 42(2): 312-318.
[13]	山珊，黄艳梅，赵雪龙，陈文瑶，刘成伟，龙中儿，刘道峰. 级联信号转导系统结合免疫层析法检测大肠埃希氏菌O157:H7[J]. 食品科学, 2021, 42(18): 314-320.
[14]	杨建飞，马倩，左勇，黄雪芹，徐佳，王定丽，周耀进，杨柯怡. 亚硝酸盐快速检测试剂研究及其在酱腌菜中的应用[J]. 食品科学, 2021, 42(18): 321-328.
[15]	黄栋玮，谷贵章，胡科娜，高兴杰，张进杰，杨文鸽，徐大伦. 基于D152树脂吸附蛋白质结合SERS测定鱼肉中的鸟嘌呤含量[J]. 食品科学, 2021, 42(18): 298-305.

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