食品科学 ›› 2017, Vol. 38 ›› Issue (10): 277-283.doi: 10.7506/spkx1002-6630-201710045
李金春,李家鹏,周 彤,乔晓玲,许随根,戚 彪,米瑞芳,曲 超,许 典
LI Jinchun, LI Jiapeng , ZHOU Tong, QIAO Xiaoling , XU Suigen, QI Biao, MI Ruifang, QU Chao, XU Dian
摘要: 以错配反应与正常反应之间的ΔCt值为指示,研究不同碱基错配类型、位置与个数条件下引物3′端与模板 之间非特异性扩增的发生规律,并构建ΔCt值的二次多项式回归模型。结果表明,碱基错配种类、位置、个数对实 时荧光定量聚合酶链式反应(quantitative real-time polymerase chain reaction,RT-qPCR)的非特异性扩增都有显著 影响,并呈现出较强的规律性。碱基类型上,研究的各个位置上异型错配较易发生非特异性扩增,而同型错配则 较难发生,并且两种错配类型之间有显著性差异(P<0.05);错配位置上,相同条件下引物3’端第1位碱基错配对 ΔCt值影响最大,错配位置远离3’端时对ΔCt值的影响逐渐减小,非特异性扩增也更容易发生;错配个数上,随着 错配碱基个数的增加对ΔCt值得影响程度不断增大,非特异性扩增较难发生。构建ΔCt值预测模型R2达到0.837 1, 根据此模型可以预测出不同位置、不同错配类型条件下ΔCt值,从而可以判断RT-qPCR非特异性扩增的发生的难易 程度。
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