鼠李糖乳杆菌JAAS8胞外多糖生物合成基因的克隆及生物信息学分析

doi:10.7506/spkx1002-6630-201117061

食品科学 ›› 2011, Vol. 32 ›› Issue (17): 292-296.doi: 10.7506/spkx1002-6630-201117061

鼠李糖乳杆菌JAAS8胞外多糖生物合成基因的克隆及生物信息学分析

李盛钰1，赵玉娟1，张雪1，戴大海1，曾宪鹏1，张贵斌2，杨贞耐1,*

1. 吉林省农业科学院农产品加工研究中心 2. 长春新高食品有限公司

发布日期:2011-08-30
基金资助:
国家现代农业产业技术体系建设专项(nycytx-0502)；吉林省博士后基金项目(04008)；　　　　　国家自然科学基金项目(30670057)

Cloning and Bioinformatic Analysis of Exopolysaccharide Biosynthesis Genes from Lactobacillus rhamnosus JAAS8

LI Sheng-yu1，ZHAO Yu-juan1，ZHANG Xue1，DAI Da-hai1， ZENG Xian-peng1，ZHANG Gui-bin2，YANG Zhen-nai1,*

(1. Center of Agro-Food Technology, Jilin Academy of Agricultural Sciences, Changchun 130033, China； 2. Changchun Xingao Food Co. Ltd., Changchun 130000, China)

Published:2011-08-30

摘要/Abstract

摘要： 根据已知乳杆菌胞外多糖生物合成基因的同源性，利用其保守区设计引物，扩增出鼠李糖乳杆菌JAAS8磷蛋白磷酸酶基因(wzb)序列，并通过染色体步移法克隆了鼠李糖乳杆菌 JAAS8 参与胞外多糖生物合成基因簇全部序列 (19.7kb)，利用生物信息学方法预测了基因簇 16个阅读框的结构和功能。结果表明，该序列与已报道的乳杆菌胞外多糖生物合成基因具有高度同源性。welF、welG、welH、welI、welJ和welE为合成寡糖重复单元的糖基转移酶基因。rmlA、rmlB和rmlC基因与dTDP-L-鼠李糖前体的生物合成密切相关。wzd、wze、wzy、wzx、wzr和wzb基因预测蛋白主要参与胞外多糖合成过程中多糖链长检测、聚合和输出。

关键词: 鼠李糖乳杆菌, 胞外多糖, 基因簇, 生物合成

Abstract: The exopolysaccharide (EPS) biosynthetic genes of Lactobacillus rhamnosus JAAS8 were located on the chromosome in a 19.7 kb region consisting of 16 open reading frames. GenBank database searching showed that the predicted protein products of the gene cluster from L. rhamnosus JAAS8 had the highest identity with the EPS biosynthetic genes of Lactobacillus. The central portion of the locus was occupied by six genes (welF, welG, welH, welI, welJ and welE) encoding potential glycosyltransferases. Three genes (rmlA, rmlB and rmlC) involved in the biosynthesis of the sugar nucleotide precursor dTDP-L-rhamnose were identified in the EPS biosynthesis locus. The predicted amino acid sequences from six genes (wzd, wze, wzy, wzx, wzr, and wzb) have the most resemble proteins involved in putative polysaccharide chain length determination, polymerization and export.

Key words: Lactobacillus rhamnosus, exopolysaccharide, gene cluster, biosynthesis

中图分类号:

S182

李盛钰，赵玉娟，张雪，戴大海，曾宪鹏，张贵斌，杨贞耐. 鼠李糖乳杆菌JAAS8胞外多糖生物合成基因的克隆及生物信息学分析[J]. 食品科学, 2011, 32(17): 292-296.

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鼠李糖乳杆菌JAAS8胞外多糖生物合成基因的克隆及生物信息学分析

Cloning and Bioinformatic Analysis of Exopolysaccharide Biosynthesis Genes from Lactobacillus rhamnosus JAAS8

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