食品科学 ›› 2023, Vol. 44 ›› Issue (24): 105-111.doi: 10.7506/spkx1002-6630-20230316-164
商静雯, 柴玉霞, 曹雪妍, 岳喜庆, 杨梅
SHANG Jingwen, CHAI Yuxia, CAO Xueyan, YUE Xiqing, YANG Mei
摘要: 采用密度梯度离心法提取牛乳外泌体,利用Illumina测序技术对外泌体中非编码小RNA(sRNA)进行测序,探索牛乳microRNA(miRNA)的表达谱。对原始序列进行质量控制,共获得3 899 629 条纯净sRNA序列,长度集中于28 nt,与数据库比对后鉴定到61 种已知miRNA,346 种新miRNA。基因本体论富集结果表明,牛乳外泌体miRNA在细胞过程、单一生物体过程、代谢过程等生物过程发挥作用;主要构成细胞、细胞器等组成;主要参与结合、催化活性、转运蛋白活性等分子功能。京都基因与基因组百科全书通路富集结果表明,已知miRNA与新miRNA靶基因均显著富集在百日咳(ko05133)、趋化因子信号通路(ko04062)、内吞作用(ko04144)、溶酶体(ko04142)等通路,牛乳外泌体miRNA在特定信号通路中发挥重要作用。
中图分类号: