驴乳外泌体中miRNA的测序与分析

doi:10.7506/spkx1002-6630-20210930-360

食品科学 ›› 2022, Vol. 43 ›› Issue (14): 151-157.doi: 10.7506/spkx1002-6630-20210930-360

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驴乳外泌体中miRNA的测序与分析

柴玉霞，王新宇，岳喜庆，杨梅

（1.沈阳农业大学食品学院，辽宁沈阳 110866；2.沈阳农业大学畜牧兽医学院，辽宁沈阳 110866）

发布日期:2022-07-28
基金资助:
辽宁省博士科研启动项目（2020-BS-135）；辽宁省兴辽英才计划项目（XLYC1902083）

Sequencing and Analysis of MicroRNAs in Donkey Milk Exosomes

CHAI Yuxia, WANG Xinyu, YUE Xiqing, YANG Mei

(1. College of Food Science, Shenyang Agricultural University, Shenyang 110866, China; 2. College of Animal Science and Veterinary Medicine, Shenyang Agricultural University, Shenyang 110866, China)

Published:2022-07-28

摘要/Abstract

摘要： 为探究驴乳外泌体中微小RNA（miRNA）的种类和功能性，利用Illumina测序技术对驴乳外泌体中非编码小RNA（sRNA）进行测序分析，鉴定其中的miRNA并以人乳外泌体miRNA作为对照组进行生物信息学分析。驴乳外泌体中sRNA在质量控制之后，长度主要分布在18～22 nt，在其中共鉴定到212 个miRNA，其中包括16 种已知miRNA和196 种新miRNA。基因本体论富集分析发现，驴乳外泌体miRNA的功能性与人乳相似，构成细胞、细胞器等组分；具有结合和催化活性等功能；参与细胞代谢、生物调节等过程。京都基因与基因组百科全书通路富集分析发现，驴乳外泌体miRNA参与醛固酮的合成与分泌、Hedgehog信号、线粒体调节、癌症等通路。

关键词: 驴乳外泌体；人乳外泌体；miRNA；Illumina测序

Abstract: In order to explore the species and functions of microRNAs (miRNAs) in donkey milk exosomes, Illumina sequencing technique was used to sequence the small non-coding RNAs (sRNAs) in donkey milk exosomes, and identify the miRNAs in them through bioinformatic analysis using human milk miRNAs as the control. After quality control, the length of the sRNAs in donkey milk exosomes was mainly distributed between 18 and 22 nt, and a total of 212 miRNAs were identified, including 16 known ones and 196 new ones. Gene Ontology (GO) enrichment analysis showed that the functions of the miRNAs in donkey milk exosomes were similar to those of human milk miRNAs, such as constituting cells, organelles and other components, binding and catalytic activity and participating in the processes of cell metabolism and biological regulation. Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway enrichment analysis revealed that the miRNAs in donkey milk exosomes participated in the synthesis and secretion of aldosterone, the Hedgehog signaling pathway, mitochondrial regulation and cancer pathways.

Key words: donkey milk exosomes; human milk exosomes; miRNA; Illumina sequencing

中图分类号:

TS252.1

柴玉霞，王新宇，岳喜庆，杨梅. 驴乳外泌体中miRNA的测序与分析[J]. 食品科学, 2022, 43(14): 151-157.

CHAI Yuxia, WANG Xinyu, YUE Xiqing, YANG Mei. Sequencing and Analysis of MicroRNAs in Donkey Milk Exosomes[J]. FOOD SCIENCE, 2022, 43(14): 151-157.

[1]	柴玉霞王新宇岳喜庆杨梅. 驴乳外泌体中miRNA的测序与分析[J]. 食品科学, 0, (): 0-0.
[2]	高文浩尹乾隆王筱迪滕翔宇任皓威刘宁. 基于脂质组学技术探究热处理和发酵对乳脂质的影响[J]. , 0, (): 0-0.
[3]	蓝航莲，施悦，张丽娜，周鹏. 4 种哺乳动物乳中低聚糖的定性和定量分析研究进展[J]. 食品科学, 2022, 43(13): 370-378.
[4]	王艺会，蔡淼，张敏，赵华，刘京，杨贞耐. 添加酪蛋白水解肽改善酸乳的加工特性[J]. 食品科学, 2022, 43(12): 34-35.
[5]	李墨翰，张秀敏，王亦宁，陈佳丽，热罕古丽，于海坤，张娟，宋婉莹，刘爱成，岳喜庆，郑艳. 牛初乳与牛常乳乳脂肪球膜中丰度差异蛋白的表征与分析[J]. 食品科学, 2022, 43(12): 163-161.
[6]	王艺会蔡淼张敏赵华刘京杨贞耐. 添加酪蛋白水解肽改善酸乳的加工特性[J]. 食品科学, 0, (): 0-0.
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[8]	李艾黎刘串马艺鸣王雪莹李春孙铭爽. 山羊乳及其制品营养与功能特性的研究进展[J]. 食品科学, 0, (): 0-0.
[9]	杨婷婷. 抗菌肽BCp12保鲜膜的制备及其对乳扇保鲜的影响[J]. 食品科学, 0, (): 0-0.
[10]	郑淇丹，樊迪，沈清武，周辉，刘成国，罗洁. 不同结晶态脂肪比例对乳液奶油感感知的影响[J]. 食品科学, 2022, 43(10): 7-14.
[11]	林爽，李晓东，刘璐，张秀秀，李春梅，冷友斌，蒋士龙. 不同脂肪来源婴儿配方乳粉与母乳脂质组成的差异分析[J]. 食品科学, 2022, 43(10): 263-270.
[12]	林爽李晓东刘璐张秀秀李春梅冷友斌蒋士龙. 不同脂肪来源婴儿配方乳粉与母乳脂质组成的差异分析[J]. 食品科学, 0, (): 0-0.
[13]	曹瑛瑛汪月杨晓丽张炎文鹏程乔海军张卫兵. 地衣芽孢杆菌凝乳酶对切达干酪成熟过程中蛋白水解的影响[J]. 食品科学, 0, (): 0-0.
[14]	曹瑛瑛，汪月，张卫兵，张忠明，王莹，宋雪梅，乔海军，杨晓丽，文鹏程. 地衣芽孢杆菌凝乳酶对切达干酪成熟过程中蛋白水解的影响[J]. 食品科学, 2022, 43(8): 97-103.
[15]	李墨翰，张秀敏，宋婉莹，于海坤，张娟，岳喜庆，郑艳. 驴初乳与常乳乳脂球膜蛋白质组的对比分析[J]. 食品科学, 2022, 43(8): 104-112.

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Sequencing and Analysis of MicroRNAs in Donkey Milk Exosomes

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