食品科学 ›› 2023, Vol. 44 ›› Issue (16): 213-219.doi: 10.7506/spkx1002-6630-20220906-059
王舸楠,李佳谦,李雨桐,陈世伟,王淑贤,赵廷彬,贾士儒,乔长晟
出版日期:
2023-08-25
发布日期:
2023-09-01
基金资助:
WANG Genan, LI Jiaqian, LI Yutong, CHEN Shiwei, WANG Shuxian, ZHAO Tingbin, JIA Shiru, QIAO Changsheng
Online:
2023-08-25
Published:
2023-09-01
摘要: 通过PacBio Sequel II及Illumina NovaSeq 6000测序平台对高产聚苹果酸(polymalic acid,PMLA)产黑色素短梗霉(Aureobasidium melanogenum)基因组进行测序,对测序得到的下机文件进行组装,并结合转录组数据进行基因结构注释。结果表明,产黑色素短梗霉基因组中共有6 202 个基因,主要参与碳水化合物转运及代谢、氨基酸转运代谢、转录后修饰、RNA加工及修饰等生物活动。功能注释结果显示基因组中有大部分基因与过氧化物体有关,进而对菌株进行透射电镜拍摄,发现菌体中存在圆形的类过氧化物体(乙醛酸体)结构,提示菌体可通过乙醛酸循环途径生成苹果酸。最后,对可能与PMLA合成有关的磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶激酶和苹果酸合成酶进行了蛋白质结构预测,发现这两种蛋白可能具备合成苹果酸的能力。本研究结果可为产黑色短梗霉菌株的PMLA代谢提供一定的参考,同时,组装的基因组文件已上传至相关数据库,为后续的菌株开发利用提供基础。
中图分类号:
王舸楠,李佳谦,李雨桐,陈世伟,王淑贤,赵廷彬,贾士儒,乔长晟. 高产聚苹果酸黑色素短梗霉CGMCC18996全基因组组装注释及关键蛋白分析[J]. 食品科学, 2023, 44(16): 213-219.
WANG Genan, LI Jiaqian, LI Yutong, CHEN Shiwei, WANG Shuxian, ZHAO Tingbin, JIA Shiru, QIAO Changsheng. Genome Assembly and Annotation of a High-Polymalic Acid (PMLA) Producing Strain Aureobasidium melanogenum CGMCC18996 and Analysis of Its Key Proteins Related to PMLA Synthesis[J]. FOOD SCIENCE, 2023, 44(16): 213-219.
[1] | 魏真 陈金玲 杨杰. 岩藻多糖降解酶的研究进展[J]. 食品科学, 0, (): 0-0. |
[2] | 孙启彪 连宾. 矿物风化与食用性菌根真菌的共生策略与可持续性[J]. 食品科学, 0, (): 0-0. |
[3] | 陈丽澜 万开瑞 孟凡姝 田丰伟 黄丽丽 倪永清. 三个不同地区母婴粪便来源嗜黏蛋白阿克曼菌菌株的分离及其体外益生特性分析[J]. 食品科学, 0, (): 0-0. |
[4] | 刘学,韩璞,陈伟,田洪涛,谷新晰. 嗜热小孢根霉GH134家族甘露聚糖酶基因的克隆表达及在果汁加工中的应用[J]. 食品科学, 2023, 44(16): 177-184. |
[5] | 李瑞一,吴伟杰,房祥军,陈杭君,韩延超,牛犇,陈慧芝,郜海燕. 紫苏醛对杨梅主要致病菌桔青霉的抑菌活性及作用机制[J]. 食品科学, 2023, 44(15): 196-211. |
[6] | 李瑞一 吴伟杰 房祥军 陈杭君 韩延超 牛犇 陈慧芝 郜海燕. 紫苏醛对杨梅主要致病菌桔青霉的抑菌活性及作用机制[J]. 食品科学, 0, (): 0-0. |
[7] | 丁一峰 张宇 刘茜 黄晨曦 邵彦春 王小红. 噬菌体Pu29特性分析及其在沙门氏菌磁分离富集中的应用[J]. 食品科学, 0, (): 0-0. |
[8] | 安俊侠 王倩倩 王昭颖 刘欢 徐庆阳 范晓光. 代谢工程改造大肠杆菌发酵生产β-烟酰胺单核苷酸[J]. 食品科学, 0, (): 0-0. |
[9] | 曹玉莹,王爽,刘怡宁,高熳熳,杜丽平,马立娟,张惠玲,田晓菊,杨伟明. 植物乳杆菌漆酶的酶学性质及其对生物胺的降解作用[J]. 食品科学, 2023, 44(12): 157-163. |
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[14] | 李青飞,刘越,言行,聂新玲,李相前,谭中标,时号. 高温木聚糖酶Pthxyn酶学性质及其在啤酒酿造中的应用[J]. 食品科学, 2023, 44(10): 181-187. |
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