PCR-DGGE分析甘薯酸浆自然发酵过程中细菌多样性

doi:10.7506/spkx1002-6630-201607019

摘要/Abstract

摘要：

以不同发酵阶段的甘薯酸浆为研究对象，采用变性梯度凝胶电泳技术（denaturing gradient gelelectrophoresis，DGGE）分析甘薯酸浆发酵过程中细菌的多样性。提取样品总DNA，聚合酶链式反应（polymerasechain reaction，PCR）扩增16S rDNA的高变区序列，再通过变性梯度凝胶电泳得到特异性条带并对其进行序列分析及比对。结果表明：甘薯酸浆自然发酵过程中，主要以厚壁菌门（Firmicutes）和变形菌门（Proteobacteria）的明串珠菌属（Leuconostoc）、不动杆菌属（Acinetobacter）、Reyranella属、泛菌属（Pantoea）、克罗诺杆菌属（Cronobacter）以及螺菌属（Spiriiium）的细菌为主；此外，还有拟杆菌门中黄杆菌属（Flavobacterium）以及蓝细菌中的色球藻属（Chroococci）的细菌参与其中。相似性分析结果表明，自然发酵甘薯酸浆中的菌群结构有很大相似性，其中最大相似度为88.5%，最小相似度为71.4%。

关键词: 甘薯酸浆, 变性梯度凝胶电泳, 优势菌种, 系统进化树, 絮凝微生物

Abstract:

In the present study, changes in the bacteria composition of sweet potato sour liquid during the natural
fermentation process were investigated by polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis (PCR-DGGE).
Total bacterial DNA was extracted from the samples, and the touch down PCR was applied to amplify the V3 region of 16S
rDNA for identification based on DGGE fingerprints. The specific gel bands were excised, then sequenced and analyzed
by comparison with the GenBank database. Results showed that the representative bacteria during the fermentation process
of sour liquid were identified as Leuconostoc, Acinetobacter, Reyranella, Pantoea, Cronobacter, Spiriiium which belong
to Firmicutes and Proteobacteria, respectively. Flavobacterium belonging to the phylum Bacteroidetes and Chroococci
belonging to the phylum Cyanobacteria were also involved. The coefficient of similarity showed that the similarity of
bacterial community in sweet potato sour liquid ranged from 88.5% to 71.4%.

Key words: sweet potato sour liquid, denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE), dominant bacteria, phylogenetic tree, flocculent microorganisms

中图分类号:

TS201.3

郑艳，姚婷. PCR-DGGE分析甘薯酸浆自然发酵过程中细菌多样性[J]. 食品科学, doi: 10.7506/spkx1002-6630-201607019.

ZHENG Yan, YAO Ting. Analysis of Bacterial Diversity during Natural Fermenation of Sweet Potato Sour Liquid by PCR-DGGE[J]. FOOD SCIENCE, doi: 10.7506/spkx1002-6630-201607019.

[1]	李希羽，高洁，李云姣，王兆凌，张兆熙，桑亚新. 水果酵素自然发酵过程中优势菌群与有机酸变化规律分析[J]. 食品科学, 2020, 41(24): 61-68.
[2]	岳晓禹，张华，陈威风，邹建，李欣，杨娜. 应用DGGE技术研究玉米储藏过程中的霉菌群落时空分布特征[J]. 食品科学, 2018, 39(4): 307-311.
[3]	文淑婷，李艳. 老白干酒曲中酵母菌多样性分析[J]. 食品科学, 2018, 39(24): 175-182.
[4]	李秀秀，曾维伟，陆兆新，别小妹，赵海珍，张充，吕凤霞. 鲫鱼贮藏过程中微生物菌相PCR-DGGE分析及其防腐保鲜[J]. 食品科学, 2017, 38(5): 274-280.
[5]	李汉荣，黄淑君，曾本华，方祥，王丽，钟青萍，童贻刚，魏泓，廖振林. 香蕉抗性淀粉对C57BL/6J肥胖小鼠肠道放线菌群的调控作用[J]. 食品科学, 2017, 38(23): 149-156.
[6]	孙慧君，张颖，王洪玉，杨梅，岳喜庆，乌日娜. 传统发酵锦州小菜中主要微生物多样性分析[J]. 食品科学, 2017, 38(2): 15-19.
[7]	朱永清，李治华，李华佳，王雪涛，董玲，黄巧莲. 基于PCR-DGGE分析不同品牌郫县豆瓣酱真菌多样性[J]. 食品科学, 2017, 38(2): 104-108.
[8]	姚鑫，赵爱静，杜苏萍，孙晓红，潘迎捷，赵勇. 酸性电解水冰对小黄鱼品质及肌肉组织中酶活力变化的影响[J]. 食品科学, 2017, 38(13): 244-250.
[9]	汪淼，李张，孙?群. PCR-DGGE分析资中冬尖发酵过程中细菌多样性[J]. 食品科学, 2017, 38(12): 119-124.
[10]	丛敏，李欣蔚，武俊瑞，岳喜庆. PCR-DGGE分析东北传统发酵酸菜中乳酸菌多样性[J]. 食品科学, 2016, 37(7): 78-82.
[11]	燕平梅，乔宏萍，赵文婧，单树花，王琪，柴政，陈燕飞. 基于PCR-DGGE方法分析榨菜中乳酸菌群落结构[J]. 食品科学, 2016, 37(13): 136-139.
[12]	张静1，胡新中2,*，李俊俊2，郑建梅1，陈杏云1，唐凌云1. 燕麦β-葡聚糖与沙蒿胶多糖对菌群人源化小鼠生理及肠道微生物调节比较研究[J]. 食品科学, 2015, 36(9): 146-153.
[13]	索化夷，赵欣，骞宇，陈娟，李键，张玉，阚建全. 永川毛霉型豆豉在发酵过程中微生物总量与区系变化规律[J]. 食品科学, 2015, 36(19): 124-131.
[14]	周琰冰，艾启俊，张德权. 应用PCR-DGGE技术研究贮藏期内冷鲜羊肉表面的优势菌[J]. 食品科学, 2015, 36(16): 236-240.
[15]	李艳1,2，董振玲1,3，李佳1，牟德华1,*. PCR-DGGE技术检测羊羔美酒大曲中细菌多样性[J]. 食品科学, 2015, 36(12): 142-147.

PCR-DGGE分析甘薯酸浆自然发酵过程中细菌多样性

Analysis of Bacterial Diversity during Natural Fermenation of Sweet Potato Sour Liquid by PCR-DGGE

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