花生过敏原Ara h 2.02 二级结构和B 细胞抗原表位预测

doi:10.7506/spkx1002-6300-200921001

食品科学 ›› 2009, Vol. 30 ›› Issue (21 ): 13-15.doi: 10.7506/spkx1002-6300-200921001

• 基础研究 • 下一篇

花生过敏原Ara h 2.02 二级结构和B 细胞抗原表位预测

胡纯秋^1,2，高金燕^1,3，罗春萍^1,2，陈红兵^1,2,*

1.南昌大学食品科学与技术国家重点实验室 2.南昌大学中德联合研究院 3.南昌大学生命科学与食品工程学院

收稿日期:2009-07-04 出版日期:2009-11-01 发布日期:2010-12-29
通讯作者: 陈红兵1,2,* E-mail:chbgjy@hotmail.com
基金资助:
南昌大学食品科学与技术国家重点实验室目标导向项目(SKLF-MB-200807)；江西省主要学科学术和技术带头人培养项目(赣科发计字[2004]234 号)；教育部新世纪优秀人才支持计划项目(NCET-08-07-04)

Prediction of Secondary Structure and B Cell Epitopes of Peanut Allergen Ara h 2.02

HU Chun-qiu1,2，GAO Jin-yan1,3，LUO Chun-ping1,2，CHEN Hong-bing1,2,*

1. State Key Laboratory of Food Science and Technology, Nanchang University, Nanchang 330047, China；
2. Sino-German Joint Research Institute, Nanchang University, Nanchang 330047, China；
3. School of Life Sciences and Food Engineering, Nanchang University, Nanchang 330047, China

Received:2009-07-04 Online:2009-11-01 Published:2010-12-29
Contact: CHEN Hong-bing1,2,* E-mail:chbgjy@hotmail.com

摘要/Abstract

摘要：

为预测花生过敏原Ara h 2.02 的二级结构和B 细胞抗原表位，通过Genbank 数据库搜索到Ara h 2.02 基因，并推导出其相应的氨基酸序列，采用SOPMA 和DNAStar 软件预测该蛋白质的二级结构以及通过Jameson-Wolf 法、Kyte-Doolittle 法、Emini 法和Karplus-Schulz 法分别预测其抗原指数、亲水性、表面可性、柔韧性等参数，并综合分析预测该蛋白的B 细胞抗原表位。结果表明：在序列28～31、56～73、76～90、92、148、156～158、168～169 区域最可能是Ara h 2.02 蛋白的B 细胞抗原表位的优势区域。该结果将为寻找Ara h 2.02 的最佳优势表位提供支持，同时为该蛋白单克隆抗体的制备等研究提供理论依据。

关键词: Ara h 2.02, 花生过敏, 二级结构, B 细胞表位

Abstract:

In order to predict the secondary structure and B cell epitopes of peanut allergen Ara h 2.02, the gene of Ara h 2.02 was searched in Genbank and its amino sequence was deduced. Meanwhile, its secondary structure was predicted with DNAStar and SOMPA, and antigenicity. hydrophilicity, surface probability and flexibility was predicted using the methods of Jameson- Wolf, Kyte-Doolittle, Emini and Karplus-eSchulz, respectively. B-cell epitopes of Ara h 2.02 were further predicted based on the comprehensive prediction analysis. Results indicated that B-cell epitopes had the high probability in the regions of 28－31, 56－73, 76－90, 92, 148, 156－158, and 168－169. These investigations will be beneficial to epitope localization of Ara h 2.02 and monoclonal antibody preparation in the future.

Key words: Ara h 2.02, peanut allergy, secondary structure, B-cell epitopes

中图分类号:

Q518.1

胡纯秋1,2，高金燕1,3，罗春萍1,2，陈红兵1,2,*. 花生过敏原Ara h 2.02 二级结构和B 细胞抗原表位预测[J]. 食品科学, 2009, 30(21 ): 13-15.

HU Chun-qiu1,2，GAO Jin-yan1,3，LUO Chun-ping1,2，CHEN Hong-bing1,2,*. Prediction of Secondary Structure and B Cell Epitopes of Peanut Allergen Ara h 2.02[J]. FOOD SCIENCE, 2009, 30(21 ): 13-15.

[1]	朱秀清，王子玥，李美莹，王源，李志敏，杨宏哲，张娜，孙冰玉. 热处理对汉麻乳稳定性的影响及蛋白结构表征[J]. 食品科学, 2021, 42(7): 68-73.
[2]	毛小雨，许馨予，杨鹄隽，贾斌，左锋. 紫花芸豆蛋白体外消化产物的抗氧化活性及结构特征分析[J]. 食品科学, 2021, 42(3): 56-62.
[3]	徐安琪，杨镕，朱煜康，盛珍珍，宋琳璐，贾茹，黄涛，杨文鸽. 紫菜粉添加对鱿鱼鱼糜凝胶特性及其蛋白结构的影响[J]. 食品科学, 2021, 42(2): 46-52.
[4]	王俊娟，李欣芮，陈成，孙善峰，刘桂蓉，车会莲. 花生主要过敏原Ara h 1线性B细胞表位的预测及鉴定[J]. 食品科学, 2021, 42(17): 106-112.
[5]	陈启航，文丽华，陈小娥，方旭波，凌建刚，宣晓婷. 超高压辅助脱壳对虾夷扇贝肌原纤维蛋白生化特性及结构的影响[J]. 食品科学, 2021, 42(11): 102-107.
[6]	冯芳，刘文豪，陈志刚. 大豆7S、11S蛋白的结构与热致凝胶特性的分析[J]. 食品科学, 2020, 41(2): 58-64.
[7]	刘芳芳，林婉玲，李来好，吴燕燕，杨少玲，黄卉，杨贤庆，林织. 海鲈鱼糜加工及凝胶形成过程中蛋白质的变化机理[J]. 食品科学, 2020, 41(14): 15-22.
[8]	王正雯, 田宏伟, 周富裕, 张志芳, 何俊, 孙杨赢, 曹锦轩, 潘道东. 加热温度对麻鸭肌原纤维蛋白结构与凝胶特性的影响[J]. 食品科学, 2020, 41(13): 61-68.
[9]	杨镕，徐安琪，朱煜康，贾茹，黄涛，徐大伦，张进杰，杨文鸽. 辐照对带鱼鱼糜内源性转谷氨酰胺酶及凝胶特性的影响[J]. 食品科学, 2020, 41(11): 71-82.
[10]	盛雪，张居典，李梦寒，崔东影，席恩泽，许晓曦. 不同热处理方式的α-乳白蛋白对正常人肠道上皮细胞株增殖、周期及凋亡的影响[J]. 食品科学, 2020, 41(1): 139-146.
[11]	张同刚，罗瑞明，李亚蕾，马梦斌，周亚玲. 拉曼光谱分析牛肉贮藏过程中肌红蛋白结构的变化[J]. 食品科学, 2019, 40(7): 15-19.
[12]	郭金英，贺亿杰，韩四海，任国艳，吴影，罗登林，刘建学. 魔芋葡甘聚糖对冷冻小麦面团面筋蛋白结构和功能特性的影响[J]. 食品科学, 2019, 40(24): 33-39.
[13]	臧学丽，陈光. 转谷氨酰胺酶交联大豆分离蛋白结构表征[J]. 食品科学, 2019, 40(24): 73-78.
[14]	钟婵，谢雪琼，孙乐常，张凌晶，刘光明，曹敏杰. 蓝圆鲹骨骼肌内源性脯氨酸内肽酶抑制剂的纯化及其抑制机理[J]. 食品科学, 2019, 40(24): 15-20.
[15]	郭莲东，徐丽，欧才智，丁阳月，张高鹏，倪春蕾，程建军. 小米蛋白的分子组成及结构特性[J]. 食品科学, 2019, 40(24): 201-206.

花生过敏原Ara h 2.02 二级结构和B 细胞抗原表位预测

Prediction of Secondary Structure and B Cell Epitopes of Peanut Allergen Ara h 2.02

RichHTML

PDF (PC)

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价