植物乳杆菌抗酸相关基因的序列特征性扩增区域(SCAR)标记

doi:10.7506/spkx1002-6630-201319038

食品科学

植物乳杆菌抗酸相关基因的序列特征性扩增区域(SCAR)标记

李凯1，朱成龙1，吕珍1，杨芮1，但霞1，刘树文1,2,*

1.西北农林科技大学葡萄酒学院，陕西杨凌 712100；2.陕西省葡萄与葡萄酒工程技术研究中心，陕西杨凌 712100

出版日期:2013-10-15 发布日期:2013-09-27
通讯作者: 刘树文
基金资助:
“十二五”国家科技支撑计划项目(2012BAD31B07)；中央高校基本科研业务费专项(2109021104)；
国家现代农业产业技术体系建设专项(nycytx-30-ch-03)

Sequence-characterized Amplified Region (SCAR) Marker Linked to Acid Resistance-related Gene in Lactobacillus plantarum

LI Kai1，ZHU Cheng-long1，LÜ Zhen1，YANG Rui1，DAN Xia1，LIU Shu-wen1,2,*

1. College of Enology, Northwest A&F University, Yangling 712100, China；
2. Shaanxi Engineering Research Center for Viti-viniculture, Yangling 712100, China

Online:2013-10-15 Published:2013-09-27
Contact: LIU Shu-wen

摘要/Abstract

摘要：

以11株抗酸性和8株酸敏性植物乳杆菌为实验菌株，采用群体分组分析法(BSA)和随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对55条引物进行筛选，并对基因池中扩增出差异性条带的引物进行单菌株验证，最终获得1个抗酸性RAPD标记：S116-680；将抗酸性RAPD特异片段回收，与pGEM-T Easy载体连接后测序；根据序列信息设计了一对特异性引物，该对引物能在11株抗酸性菌株中稳定扩增出一条680bp的特异性条带，命名为SA-680抗酸性相关标记。

关键词: 植物乳杆菌, 抗酸相关基因, RAPD标记, SCAR标记

Abstract:

Totally 11 acid-resistant Lactobacillus plantarum strains and 8 acid-sensitive Lactobacillus plantarum strains
were investigated, and random amplified polymorphic DNA (RAPD) and bulked segregate analysis (BSA) techniques were
employed in this study. One RAPD marker S116-680 related to acid resistance in Lactobacillus plantarum was obtained
through the selection from 55 random primers and the confirmation in a single Lactobacillus plantarum strain. The specific
fragments were recovered and ligated into pGEM-T Easy vector, and then sequenced. According to the sequence information,
a pair of specific primers (SA1/SA2) were designed, and SA1/SA2 with stable amplification of a 680bp specific band from
11 acid-resistant strains, was named as SA-680 acid resistance-related marker.

Key words: Lactobacillus plantarum, acid-resistant gene, RAPD marker, SCAR marker

中图分类号:

Q93.3
Q78

李凯1，朱成龙1，吕珍1，杨芮1，但霞1，刘树文1,2,*. 植物乳杆菌抗酸相关基因的序列特征性扩增区域(SCAR)标记[J]. 食品科学, doi: 10.7506/spkx1002-6630-201319038.

LI Kai1，ZHU Cheng-long1，Lü Zhen1，YANG Rui1，DAN Xia1，LIU Shu-wen1,2,*. Sequence-characterized Amplified Region (SCAR) Marker Linked to Acid Resistance-related Gene in Lactobacillus plantarum[J]. FOOD SCIENCE, doi: 10.7506/spkx1002-6630-201319038.

[1]	李欣芮，赵桉，范小飘，高文文，尚佳萃，赵鹏昊，赵乐，周雪，孟祥晨. 植物乳杆菌KLDS1.0391 PurR和PurL蛋白的原核表达、纯化及其与细菌素合成启动子的相互作用[J]. 食品科学, 2021, 42(6): 75-81.
[2]	吴领风，韦双，陈莹，杜敏杰，刘四新，王露，李从发. 低聚果糖对植物乳杆菌A33发酵酸角汁的影响[J]. 食品科学, 2021, 42(4): 122-129.
[3]	雷文平，周辉，陈绮，周杏荣，吴坤，汪家琦，刘成国. 具有透明质酸酶抑制活性益生菌的体外筛选及鉴定[J]. 食品科学, 2021, 42(2): 151-157.
[4]	肖叶，叶精勤，李晓晨，李晓晖，施文正，卢瑛. 植物乳杆菌（Lactobacillus plantarum）对过敏原原肌球蛋白免疫活性的消减作用[J]. 食品科学, 2021, 42(18): 95-102.
[5]	赵乐，张晓桐，刘利军，谢水琪，靳奇文，孟祥晨. 氨基酸对植物乳杆菌KLDS1.0391生长及细菌素合成的影响[J]. 食品科学, 2021, 42(18): 37-44.
[6]	高兆建，黄亮浩，丁飞鸿，赵宜峰，陈腾. 源自泡菜的植物乳杆菌产新型广谱抑菌细菌素的特性分析[J]. 食品科学, 2021, 42(10): 171-177.
[7]	方来杉，赖强，钟泽民，黄毓茂. 植物乳杆菌内源性质粒序列分析及其表达载体的构建[J]. 食品科学, 2020, 41(4): 118-124.
[8]	陆洲，戴意强，Hafiz Abdul RASHEED，吴寒，夏秀东，董明盛. 植物乳杆菌D1501发酵黄浆水的抑菌活性及其中细菌素的分离与鉴定[J]. 食品科学, 2020, 41(24): 117-124.
[9]	张羽竹，王冰宜，曾梓敖，徐若芸，李军，樊明涛，魏新元. 植物乳杆菌还原形成不同粒径纳米硒的培养条件及其生物活性分析[J]. 食品科学, 2020, 41(22): 119-126.
[10]	李强坤，柳陈坚，罗义勇，杨恩，李晓然. 发酵条件对植物乳杆菌叶酸合成的影响[J]. 食品科学, 2020, 41(2): 114-118.
[11]	国立东，张文文，刘艳，黄梦玲，门悦，张燕丽，王丽群. 传统发酵东北酸菜中植物乳杆菌HUCM115的分离及益生特性[J]. 食品科学, 2020, 41(18): 140-145.
[12]	刘尧尧，李璐，柳婷婷，张珊珊，荀一萍，朱宏，王世杰，边艳青，赵宝华. 植物乳杆菌菌粉对肥胖大鼠肠道黏膜屏障功能的影响[J]. 食品科学, 2020, 41(17): 153-160.
[13]	张楠笛，祝林，许琴，向文良. 食窦魏斯氏菌协同植物乳杆菌改善四川泡菜风味[J]. 食品科学, 2020, 41(14): 102-108.
[14]	姜帅铭，马臣臣，游政凯，张家超. 基于菌株水平肠道内植物乳杆菌定性定量研究方法的建立[J]. 食品科学, 2020, 41(14): 82-87.
[15]	王红梅，蒋思睿，陶阳，韩永斌. 超声辅助植物乳杆菌发酵苹果汁及草莓汁过程中菌体生长及酚类等物质代谢[J]. 食品科学, 2020, 41(14): 72-81.

植物乳杆菌抗酸相关基因的序列特征性扩增区域(SCAR)标记

Sequence-characterized Amplified Region (SCAR) Marker Linked to Acid Resistance-related Gene in Lactobacillus plantarum

RichHTML

PDF (PC)

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价