食品科学 ›› 2023, Vol. 44 ›› Issue (6): 165-171.doi: 10.7506/spkx1002-6630-20220418-233
赵磊,徐琼,刘洋,张奕南,钟江
出版日期:
2023-03-27
发布日期:
2023-03-27
基金资助:
ZHAO Lei, XU Qiong, LIU Yang, ZHANG Yinan, ZHONG Jiang
Online:
2023-03-27
Published:
2023-03-27
摘要: 为深入探究球形赖氨酸芽孢杆菌C5.1(Lysinibacillus sphaericus C5.1)菌株产VB12的作用机制,利用PacBio Sequel和Illumina NovaSeq PE150相结合的方法对C5.1菌株进行全基因组测序,并对测序数据进行拼接、基因预测及功能注释。结果表明,C5.1菌株基因组为一个环状DNA,不含质粒,大小为4 690 817 bp,GC含量为37.21%,预测得到4 756 个编码基因,111 个tRNA基因和34 个rRNA基因。通过基因本体论、直系同源集、京都基因与基因组百科全书和转运蛋白分类数据库对C5.1菌株基因组进行注释分析,分别匹配到3 095、3 182、4 374 个和397 个基因。进一步分析发现C5.1菌株基因组中包含从尿卟啉原III逐步转化合成VB12的关键酶。本研究为解析C5.1菌株在臭腐乳发酵过程中的代谢机理提供遗传信息基础,也为今后开展发酵食品中VB12的生物合成机制研究提供理论支撑。
中图分类号:
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