食品科学 ›› 2023, Vol. 44 ›› Issue (20): 119-126.doi: 10.7506/spkx1002-6630-20221126-303
郑雪,梁琪,宋雪梅,张炎
出版日期:
2023-10-25
发布日期:
2023-11-07
基金资助:
ZHENG Xue, LIANG Qi, SONG Xuemei, ZHANG Yan
Online:
2023-10-25
Published:
2023-11-07
摘要: 融合魏斯氏菌(Weissella confusa)ZW21是1 株具有良好抗菌活性的牦牛乳源乳酸菌,为探索其抗菌机理,分析其全基因组序列并挖掘该菌株的抗菌等功能特性基因。本研究基于Illumina NovaSeq PE150平台对W. confusa ZW21进行全基因组测序分析,并采用基因功能、京都基因与基因组百科全书、蛋白质直系同源簇、非冗余蛋白、碳水化合物活性酶数据库、转运蛋白分类数据库进行基因组基本功能注释。结果表明:W. confusa ZW21的基因组大小为2.44 Mb,GC含量45.66%;预测到2 175 个编码基因,编码基因总长度为1 947 771 bp,平均长度为896 bp;通过功能数据库对该菌株基因组基本功能注释和代谢通路基因信息注释可知,基因组中含有8 种细菌素(如大肠菌素V和乳球菌素)相关基因、3 种与抗氧化活性相关基因,以及可调控免疫和炎症信号通路(如核苷酸结合寡聚化结构域样受体蛋白受体信号通路、过氧化物酶体增殖物激活受体信号通路)和编码抗叶酸的基因。综上,W. confusa ZW21全基因组测序及分析为研究其抗菌机理提供基础。
中图分类号:
郑雪,梁琪,宋雪梅,张炎. 1 株牦牛乳源产细菌素融合魏斯氏菌ZW21全基因组测序及序列分析[J]. 食品科学, 2023, 44(20): 119-126.
ZHENG Xue, LIANG Qi, SONG Xuemei, ZHANG Yan. Whole Genome Sequencing and Sequence Analysis of a Yak Milk-Derived Bacteriocin-Producing Weissella confusa ZW21[J]. FOOD SCIENCE, 2023, 44(20): 119-126.
[1] | 尹树磊 杜香 张小希 刘璐 易俊洁 王艳菲. 乳酸菌抗氧化机制研究进展及在食品领域的应用[J]. 食品科学, 0, (): 0-0. |
[2] | 马妍. T-2毒素降解菌株的筛选、鉴定与降解机制分析[J]. 食品科学, 0, (): 0-0. |
[3] | 王宇良 李志溥 苏泽佳 白卫东 费永涛 赵文红 方毅斐 陈少平. 不同制曲方式对豉香型白酒酒曲理化因子及细菌群落的影响[J]. 食品科学, 0, (): 0-0. |
[4] | 李玉蝶 李玟君 汪海燕 宋青云 庞子皓 肖一郎 汪超 李玮. 戊糖乳杆菌发酵对花生不同蛋白组分结构的影响[J]. 食品科学, 0, (): 0-0. |
[5] | 姜松松 王涛 虞丹丹 汤鑫磊 李倩 黄雨彤 孟祥忍. 芝麻蛋白Ses i 3的重组表达及致敏性鉴定[J]. 食品科学, 0, (): 0-0. |
[6] | 王玉荣 侯强川 田龙新 刘菊珍 周加平 郭壮. 酱香白酒第五轮次窖池发酵不同分层酒醅微生物群落与感官理化性质差异分析[J]. 食品科学, 0, (): 0-0. |
[7] | 冻梓杰 索标 黄阳阳 周伟涛 黄忠民 艾志录 郑琦 王晓杰. 糯米面团中金黄色葡萄球菌模型构建[J]. 食品科学, 0, (): 0-0. |
[8] | 蓝彩娟 陈洁仪 何雨薇 麻春阳 黄蕊 Nima Azarakhsh Tanushree Gupta 吴希阳. 壳聚糖-姜黄素光动力协同作用对圣女果食源性致病菌的灭活效果[J]. 食品科学, 0, (): 0-0. |
[9] | 朱荻 陈莎男 梅晓宏 岳庆 常茹欣 李星 刘斌 张华磊 韩小龙 李媛. 提高益生菌耐加工贮藏稳定性和体内存活率的递送系统研究进展[J]. 食品科学, 0, (): 0-0. |
[10] | 马悦 单嘉宇 蒋耀东 王旭 张凌魁 黄骏楠 杨朔 董庆利. 酵母菌及其衍生物抗菌功能的研究进展[J]. 食品科学, 0, (): 0-0. |
[11] | 赵青 刘欣 牛洪梅 朱华剑 潘馨叶 刘阳泰 杨捷琳 董庆利. 食源性致病菌活的不可培养状态诱导、复苏及检测的研究进展[J]. 食品科学, 0, (): 0-0. |
[12] | 朱荻, 陈莎男, 梅晓宏, 岳庆, 常茹欣, 李星, 刘斌, 张华磊, 韩小龙, 李媛. 提高益生菌耐加工贮藏稳定性和体内存活率的递送系统研究进展[J]. 食品科学, 2023, 44(21): 1-13. |
[13] | 李玉珍, 肖怀秋, 刘淼, 王琳, 曾梦琪, 赵谋明. 金属抗菌肽SIF4基于胞内生物大分子靶点的大肠杆菌非膜损伤抑菌机理[J]. 食品科学, 2023, 44(21): 62-68. |
[14] | 蓝彩娟, 陈洁怡, 何雨薇, 麻春阳, 黄蕊, Nima AZARAKHSH, Tanushree GUPTA, 吴希阳. 壳聚糖-姜黄素光动力协同作用对圣女果食源性致病菌的灭活效果[J]. 食品科学, 2023, 44(21): 258-273. |
[15] | 赵青, 刘欣, 牛洪梅, 朱华剑, 潘馨叶, 刘阳泰, 杨捷琳, 董庆利. 食源性致病菌活的不可培养状态诱导、复苏及检测的研究进展[J]. 食品科学, 2023, 44(21): 377-385. |
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