转基因大豆MON89788双重数字PCR通用定量检测方法的建立

doi:10.7506/spkx1002-6630-201804047

食品科学 ›› 2018, Vol. 39 ›› Issue (4): 312-319.doi: 10.7506/spkx1002-6630-201804047

转基因大豆MON89788双重数字PCR通用定量检测方法的建立

刘津1，李婷1，冼钰茵1，吴希阳2，凌莉1，高东微1,*

（1.广东检验检疫技术中心，广东省动植物与食品进出口技术措施研究重点实验室，广东广州 510623；2.暨南大学理工学院，广东广州 510632）

出版日期:2018-02-25 发布日期:2018-02-02
基金资助:
广东省科技计划项目（2014A040401029；2015A030401042）；国家质检总局科技计划项目（2016IK055）；出入境检验检疫行业标准制定计划项目（2015B218k）

An Universal Quantitative Detection Method for Genetically Modified Soybean Event MON89788 Using Duplex Digital PCR

LIU Jin1, LI Ting1, XIAN Yuyin1, WU Xiyang2, LING Li1, GAO Dongwei1,*

(1. Guangdong Key Laboratory of Import and Export Technical Measures of Animal, Plant and Food, Guangdong Inspection and Quarantine Technology Center, Guangzhou 510623, China; 2. College of Science and Engineering, Jinan University, Guangzhou 510632, China)

Online:2018-02-25 Published:2018-02-02

摘要/Abstract

摘要： 建立一种特异、稳定、灵敏、通用的转基因大豆MON89788品系双重数字聚合酶链式反应（digital polymerase chain reaction，dPCR）定量检测方法，在一个体系内同时进行内外源基因的定量检测，适用于微滴式数字PCR（droplet digital PCR，ddPCR）和芯片式数字PCR（chip digital PCR，cdPCR）平台，并通过了食品分析能力评价体系国际能力验证项目的盲样检测评价。ddPCR平台对大豆MON89788品系和内源Lectin的绝对定量限分别为8.0copies/μL和8.2copies/μL；cdPCR平台对大豆MON89788品系和内源Lectin的绝对定量限分别为7.443copies/μL和7.646copies/μL；ddPCR和cdPCR对转基因大豆MON89788品系成分相对含量的相对定量限均为0.1%。

关键词: 微滴式数字PCR, 芯片式数字PCR, 转基因大豆MON89788品系, 定量检测

Abstract: An universal quantitative detection method for genetically modified (GM) soybean event MON89788 using duplex digital PCR (dPCR) with satisfying specificity, stability and sensitivity was established in this paper. This method could quantify both the endogenous and exogenous genes in a single reaction system and was demonstrated to be suitable for both droplet digital PCR (ddPCR) and chip digital PCR (cdPCR) platforms. The method then was used to qualify blind samples by a food analysis performance assessment scheme (FAPAS) test. The absolute limits of quantitation (LOQs) of ddPCR for MON89788 event-specific gene and lectin endogenous gene were 8.0 copies/μL and 8.2 copies/μL, respectively, while those of cdPCR were 7.443 copies/μL and 7.646 copies/μL, respectively. The relative LOQs of MON89788 were both 0.1% by ddPCR and cdPCR.

Key words: droplet digital PCR, chip digital PCR, GM soybean event MON89788, quantitative detection

中图分类号:

Q756
TS207.3

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An Universal Quantitative Detection Method for Genetically Modified Soybean Event MON89788 Using Duplex Digital PCR

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