基于高通量测序技术分析蜂粮微生物多样性

doi:10.7506/spkx1002-6630-20190402-023

食品科学 ›› 2020, Vol. 41 ›› Issue (10): 94-100.doi: 10.7506/spkx1002-6630-20190402-023

基于高通量测序技术分析蜂粮微生物多样性

刘玥佳，韩业君，彭文君，牛庆生，方小明，赵亚周，田文礼

（1.中国农业科学院蜜蜂研究所，北京 100093；2.中国科学院过程工程研究所，北京 100190；3.吉林省养蜂科学研究所，吉林吉林 132013）

出版日期:2020-05-25 发布日期:2020-05-15
基金资助:
国家现代农业（蜜蜂）产业技术体系建设专项（NCYTI-43-KXJ17）；中国农业科学院科技创新工程项目（CAAS-ASTIP-2015-IAR）；国家自然科学基金面上项目（31871861）

Analysis of Microbial Community Diversity in Bee Bread by High-throughput Sequencing

LIU Yuejia, HAN Yejun, PENG Wenjun, NIU Qingsheng, FANG Xiaoming, ZHAO Yazhou, TIAN Wenli

(1. Institute of Apicultural Research, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100093, China; 2. Institute of Process Engineering, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100190, China；3. Jilin Province Institute of Apicultural Science, Jilin 132013, China)

Online:2020-05-25 Published:2020-05-15

摘要/Abstract

摘要： 为分析蜂粮发酵过程中微生物多样性和菌群动态变化，探究不同发酵时间对蜂粮微生物菌群组成的影响，以发酵0.5、4、7、12 d的卡尼鄂拉蜂（Apis mellifera carnica）蜂粮为研究对象，采用高通量测序技术分析不同发酵时间蜂粮微生物的16S rDNA序列，比较各组菌群构成和丰度信息，通过α多样性分析和蜂粮菌群组成分析，考察蜂粮中的优势菌群。在4 个蜂粮样品中共鉴定出27 个门、112 个属的细菌，其中4 个样品中有25 个共有菌属。结果表明：测序深度有效地覆盖了微生物种类，随着发酵时间的延长，蜂粮微生物群落的物种丰富度和多样性先升高后降低。基于门水平，生氧光细菌门（Oxyphotobacteria）和变形菌门（Proteobacteria）为优势菌群；基于属水平，unidentified Oxyphotobacteria为优势微生物。发酵过程中，unidentified Oxyphotobacteria表现出先增加后减少的趋势。

关键词: 蜂粮, 微生物群落多样性, 高通量测序

Abstract: Bee bread is a fermented food with great development potential. The objective of this study was to analyze the dynamic changes in microbial communities of bee bread during fermentation, and to evaluate the effect of fermentation time on the microflora compositions. Bee bread samples of Apis mellifera carnica fermented for 0.5, 4, 7 and 12 d were collected, and their microbial 16S rDNA sequences were evaluated by high-throughput sequencing. The microbial community diversity and composition in these samples were comparatively analyzed. A total of 27 phyla and 112 genera of bacteria were identified in the 4 samples. Besides, there were 25 genera common to the 4 samples. Moreover, the sequencing depth in this study effectively covered all the microbial species, along with the fermentation process, microbial richness and diversity were increased first and then decreased. Oxyphotobacteria and Proteobacteria were dominant at the phylum level. At the genus level, unidentified Oxyphotobacteria was the dominant microorganism in bee bread. Along with the fermentation process, the unidentified Oxyphotobacteria increased first and then decreased.

Key words: bee bread, microbial community diversity, high-throughput sequencing

中图分类号:

Q939.9

刘玥佳，韩业君，彭文君，牛庆生，方小明，赵亚周，田文礼. 基于高通量测序技术分析蜂粮微生物多样性[J]. 食品科学, 2020, 41(10): 94-100.

LIU Yuejia, HAN Yejun, PENG Wenjun, NIU Qingsheng, FANG Xiaoming, ZHAO Yazhou, TIAN Wenli. Analysis of Microbial Community Diversity in Bee Bread by High-throughput Sequencing[J]. FOOD SCIENCE, 2020, 41(10): 94-100.

[1]	王勇，宋歌，庞邵杰，綦文涛. 应用Illumina NovaSeq测序技术比较3 种杂粮对大鼠肠道菌群的影响[J]. 食品科学, 2021, 42(9): 100-106.
[2]	陈蒙恩，赵聪，韩素娜，周丹凤，李建民，张劲，黄润娜，王晓毅，邓杰，胡晓龙. 基于高通量测序的陶融型大曲微生物群落结构分析[J]. 食品科学, 2021, 42(8): 106-113.
[3]	母雨，苏伟，母应春. 盘县火腿深度腐败的微生物及挥发性风味化合物表征[J]. 食品科学, 2021, 42(8): 221-228.
[4]	朱治宇，黄永光. 基于高通量测序对茅台镇酱香白酒主酿区霉菌菌群结构多样性的解析[J]. 食品科学, 2021, 42(8): 150-156.
[5]	吴聪，葛科立，路宗博，郑征，张金玉，薛美兰，葛银林. n-3多不饱和脂肪酸对小鼠血液外泌体中miRNA的调节和抑制肥胖作用[J]. 食品科学, 2021, 42(7): 176-184.
[6]	彭潇，邹文静，邵清清，孙中贯，张立华，李贺贺，王雪山. 石榴酒发酵过程中真菌种群演替及风味物质代谢规律解析[J]. 食品科学, 2021, 42(6): 157-163.
[7]	鲍伟，韩姣姣，张旨轩，芦晨阳，周君，明庭红，李晔，苏秀榕. 基于高通量测序技术对浙江传统发酵蔬菜微生物多样性的解析[J]. 食品科学, 2021, 42(6): 178-185.
[8]	郭壮，王玉荣，葛东颖，尚雪娇，张振东，赵慧君. 腊肠发酵过程中细菌多样性评价及其对风味的影响[J]. 食品科学, 2021, 42(6): 186-192.
[9]	娄海伟，赵玉，赵逸，林俊芳，赵仁勇，叶志伟，郭丽琼. 蛹虫草转录组分析及类胡萝卜素生物合成相关基因的挖掘[J]. 食品科学, 2021, 42(6): 150-156.
[10]	陈卓，吴学凤，穆冬冬，何莹，张明珠，蔡静，侯志刚，郑志，梁进，张钰萌，李兴江. 红腐乳后酵期风味物质与细菌菌群分析[J]. 食品科学, 2021, 42(6): 118-125.
[11]	赵文鹏，李浩，杨慧林，王筱兰. 曲霉型豆豉发酵阶段细菌群落的演替及其与环境因子的关系[J]. 食品科学, 2021, 42(4): 138-144.
[12]	任爱容，黄永光. 茅台镇不同主酿区域酱香型白酒酿造大曲中细菌菌群结构分析[J]. 食品科学, 2021, 42(4): 167-174.
[13]	黎瑶依，胡小霞，黄永光. 茅台镇酱香型白酒酿造环境中真菌菌群多样性分析[J]. 食品科学, 2021, 42(18): 164-170.
[14]	卢昌丽，熊香元，龚慧可，任佑华，陈力力，刘焱. 不同季节新鲜鸭蛋表面污染细菌的多样性分析[J]. 食品科学, 2021, 42(18): 306-313.
[15]	韩国强，孙协平，吴鹏飞，陈今朝，陈春，王庆. 基于高通量测序分析复配小曲白酒发酵过程中微生物群落结构及多样性[J]. 食品科学, 2021, 42(18): 80-85.

基于高通量测序技术分析蜂粮微生物多样性

Analysis of Microbial Community Diversity in Bee Bread by High-throughput Sequencing

RichHTML

PDF (PC)

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价