苦荞类异黄酮还原酶基因(FtIRL)的克隆及序列分析

doi:10.7506/spkx1002-6630-201211045

食品科学 ›› 2012, Vol. 33 ›› Issue (11): 210-214.doi: 10.7506/spkx1002-6630-201211045

苦荞类异黄酮还原酶基因(FtIRL)的克隆及序列分析

赵海霞，李成磊，白悦辰，陈惠，吴琦*

四川农业大学生命科学与理学院

出版日期:2012-06-15 发布日期:2012-07-27

Cloning and Sequence Analysis of the Isoflavone Reductase-like (FtIRL) Gene from Fagopyrum tatarium

ZHAO Hai-xia，LI Cheng-lei，BAI Yue-chen，CHEN Hui，WU Qi*

(College of Life and Basic Sciences, Sichuan Agricultural University, Ya’an 625014, China)

Online:2012-06-15 Published:2012-07-27

摘要/Abstract

摘要： 利用RT-PCR技术，从苦荞(Fagopyrum tatarium)中克隆得到类异黄酮还原酶基因(IRL)的开放阅读框序列(ORF)，命名为FtIRL。序列分析表明：FtIRL含一个长942bp的ORF，编码313个氨基酸，其氨基酸序列与金荞异黄酮还原酶FcIFR (GenBank登录号ABV02071)同源性最高，达到97%；与其他植物IRL同源性为44%～73%。生物信息学分析表明：FtIRL推导的蛋白质含有典型的底物结合口袋和保守的NADPH结合位点，符合短链脱氢酶家族的结构特征。构建基于氨基酸的系统发育树表明，苦荞FcIFR虽然在氨基酸序列上与其他植物的异黄酮还原酶(IFR)有较高的同源性，但其生物学功能可能更接近落叶松脂醇还原酶(PLR)。

关键词: 苦荞, 类异黄酮还原酶, 基因克隆, 序列分析

Abstract: The cDNA sequence of isoflavone reductase-like gene IRL from Fagopyrum tataricum was amplified by RT-PCR. Sequencing showed that the ORF of IRL gene from F. tataricum (named as FtIRL) was 942bp, probably encoding a protein of 313 amino acids. Further analysis indicated that the deduced FcIFR protein had homology values of 97% with other plants, IRLs. FtIRL possessed two short-chain dehydrogenase/reductase conserved motifs: a substrate-binding pocket and a NADPH binding site. The phylogenetic tree constructed based on amino acid sequences indicated that, although the amino acid sequence of IRL gene from F. tataricum had high homology with that of isoflavone reductase (IFR) genes from other plants, its biological function might be more similar to that of pinoresinol lariciresinol reductase (PLR).

Key words: Fagopyrum tataricum, isoflavone reductase-like protein, gene cloning, sequence analysis

中图分类号:

赵海霞，李成磊，白悦辰，陈惠，吴琦. 苦荞类异黄酮还原酶基因(FtIRL)的克隆及序列分析[J]. 食品科学, 2012, 33(11): 210-214.

ZHAOHai-xia，LICheng-lei，BAIYue-chen，CHENHui，WUQi. Cloning and Sequence Analysis of the Isoflavone Reductase-like (FtIRL) Gene from Fagopyrum tatarium[J]. FOOD SCIENCE, 2012, 33(11): 210-214.

[1]	何晓琴，刘昕，李苇舟，赵吉春，李富华，明建. 蒸汽爆破处理苦荞麸皮膳食纤维改性分析[J]. 食品科学, 2021, 42(9): 46-54.
[2]	申进玲，赵丽娜，韩伟，许镇坚，蒋原，杨捷琳，郭德华，薛峰. 上海进口水产品中副溶血性弧菌耐药性、毒力基因和遗传特征[J]. 食品科学, 2021, 42(8): 264-269.
[3]	柴多，王美婷，姜雨萌，刘泷泽，肖琳，王缤晨，董亮. 苦荞麦不同部位代谢轮廓及活性成分分布[J]. 食品科学, 2021, 42(2): 212-217.
[4]	杨其乐，丁一峰，张宇，聂若男，李亚萌，王佳，王小红. 沙门氏菌噬菌体LPST144尾纤维gp38的序列分析及其结合活性[J]. 食品科学, 2021, 42(2): 66-73.
[5]	仇菊，朱宏，吴伟菁. 苦荞中可溶性及不可溶性膳食纤维调控糖尿病小鼠糖脂代谢的功效[J]. 食品科学, 2021, 42(15): 129-135.
[6]	程佳钰，高利，汤晓智. 超微粉碎对苦荞面条品质特性的影响[J]. 食品科学, 2021, 42(15): 99-105.
[7]	费烨，王雍，龚仕英，田艳，王筑婷，雷霆雯，张礼林，汪希兰，李红梅. 苦荞清蛋白酶解物对高糖诱导的HepG2细胞胰岛素抵抗的保护作用[J]. 食品科学, 2021, 42(1): 222-227.
[8]	孙亚利，周文美，黄永光，王小平，周敏. 以聚合乳清蛋白为壁材的苦荞黄酮微胶囊化及其品质分析[J]. 食品科学, 2020, 41(12): 259-266.
[9]	周小理，张欢，周一鸣，刘泰驿，闫贝贝，肖瀛. 基于代谢组学研究苦荞蛋白对高脂血症小鼠的干预作用[J]. 食品科学, 2019, 40(5): 149-155.
[10]	肖杰，王曦，侯粲，牛兴和，董志忠，应剑. 苦荞调控糖脂代谢作用及其生物学机制研究进展[J]. 食品科学, 2019, 40(21): 343-349.
[11]	周一鸣，赵燊，冯飞，刘倩，周小理，肖瀛. 凝固型苦荞酸奶对小鼠肠道菌群的调节作用[J]. 食品科学, 2019, 40(13): 123-129.
[12]	杨二万，张敏，杨兴斌，杨红燕. 苦荞茶多糖诱导人肺腺癌A549细胞凋亡的线粒体机制[J]. 食品科学, 2019, 40(13): 110-115.
[13]	陈思敏，罗彤晖，费永涛，吴健锋，刘冬梅. 蜡样芽孢杆菌Bacillus cereus LJ01中亚硝酸盐还原酶的基因克隆、表达和纯化[J]. 食品科学, 2018, 39(6): 69-74.
[14]	吴京，王文文，熊蓉露，吴振，潘道东，曾小群，郭宇星. 嗜酸乳杆菌ATCC4356分选酶A基因克隆、表达及功能分析[J]. 食品科学, 2018, 39(4): 76-81.
[15]	郑晨曦，郝建雄，宋曙辉，江正强，刘海杰,. 微酸性电解水对苦荞芽活性成分及抗氧化能力的影响[J]. 食品科学, 2018, 39(4): 20-25.

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